MINIX viene con los sistemas de ficheros.

root      /usr

Cuando el sistema se arranca el sistema de ficheros root se copia en memoria principal en el disco virtud RAM. 

Cualquier modificación en los ficheros o directorios del árbol principal (root) en memoria RAM, hay que guardarla en disco con el comando cp si no se quiere perder al apagarse el sistema. 

Los contenidos de los sistemas de ficheros pueden ser reorganizados, realizando mount y cp secuencialmente y conseguir que los programas más utilizados se encuentren el el root, si bien hay que guardar la precaución de guardar al menos 100k para /tmp.